肿瘤周围的组织可能不正常，即使在显微镜下看起来正常，正如这篇癌流文章所解释的。扩大功劳：加利福尼亚大学旧金山分校的博士，Dvir Aran从一项新的研究中发现，肿瘤周围的组织可能不正常，即使在显微镜下看起来正常。
更确切地说，与肿瘤相邻的组织，通常用于研究以代表患者的正常细胞，具有区别于健康组织和肿瘤组织的特征。
在分子水平上，组织似乎处于健康组织和肿瘤组织之间的“独特中间状态”，加州大学旧金山分校（UCSF）的研究人员在10月20日的《自然通讯》杂志上报道，
通过比较同一患者的健康细胞和肿瘤细胞，可以揭示与癌症相关的分子变化。几十年来，医生通过从肿瘤周围区域收集组织获得健康细胞。
，但对这种组织的基因组特征知之甚少。为了了解更多，加州大学旧金山分校的研究人员结合并分析了NCI和美国国立卫生研究院（NIH）支持的两个项目开放存取数据库的结果：癌症基因组图谱（TCGA）和基因型组织表达（GTEx）项目。
具体来说，他们比较了6个基因型的分子结构，500个组织样本：来自TCGA的癌组织和邻近组织以及来自GTEx的非肿瘤组织。这些样本代表了身体中的八个癌症部位，包括乳腺、肝脏、结肠和前列腺。
这项分析揭示了所有八个部位的模式：某些信号通路在肿瘤附近的组织中被激活，但在肿瘤本身或非肿瘤组织中没有被激活。研究人员还鉴定了一组18个基因，这些基因至少在4个部位的肿瘤邻近组织中特异表达。
“我们的发现表明肿瘤与宿主组织相互作用，”研究人员Dvir Aran说，“我们认为可能所有的肿瘤都与邻近组织有这种类型的相互作用。”
研究人员已经知道癌细胞与肿瘤周围的微环境有广泛的相互作用，”NCI癌症生物学部主任Dinah Singer博士补充道。“这里的新颖之处在于，这种相互作用的范围超出了看起来病理正常的组织。”
整合了来自不同数据库
的结果，因为健康人通常不会捐献器官用于研究，来自无癌个体的正常组织样本极为罕见。
目前的研究是通过两个开放存取的基因组数据库，以及通过肿瘤模型论坛从NCI获得资金，加州大学旧金山分校计算健康科学研究所的Atul Butte博士指出，谁领导了这项研究。
我们意识到我们可以把这两个由NIH资助的主要数据集放在一起，然后问：癌症周围的组织发生了什么？巴特医生说。“我非常喜欢使用开放数据来提出一些可能无法解决的问题。”
GTEx项目包括来自已故捐赠者的数千个组织样本的基因组图谱，其中包括许多没有癌症的个体。TCGA具有数千个肿瘤样本和数百个来自多个组织的肿瘤邻近样本的基因组图谱。
在比较组织样本之前，研究人员首先表明，来自两个不同数据库的结果可以一起分析。例如，他们发现，在整个数据集中，某些基因的表达水平“高度一致”。研究人员承认，一项“完美的研究”将使用从同一个人身上新收集的正常和癌症样本，但他说，他们的研究结果表明GTEx和TCGA数据可以一起分析。
“这是一项非常有趣的研究，”同时也是NCI癌症生物学部门的Cheryl Marks博士说
