液体活检证实与乳腺癌组织活检一致

根据Fox Chase癌症中心研究人员的一项研究,在血液中循环游离DNA可能是一种更有效的方法来测量乳腺癌患者的疾病并跟踪疾病的进展.

循环游离DNA(cfDNA)可能是一种更有效的检测乳腺癌患者疾病和跟踪疾病进展的方法,根据Fox Chase癌症中心研究人员的一项研究,1

液体活检与其他基因检测方法(如用肿瘤活检采集样本)相比,具有独特的优势。在血液中采集样本是一种微创的方法,可以更好地了解整个癌症。通常,从肿瘤的一侧而不是另一侧进行活检可能会影响结果的准确性。

“这些肿瘤会把‘垃圾’扔进‘下水道系统’,这就是我们的血流。”。“有时我们想检测肿瘤,但肿瘤很深,很难用针扎进去,否则对病人很危险,”Fox Chase血液/肿瘤系助理教授Jennifer Winn医学博士、医学硕士Jennifer Winn说,“另一种方法是检测‘垃圾’,所以cfDNA基本上就是用这个概念。肿瘤将DNA流到血流中,比针头活检更容易抽血。

19例Ⅲ、Ⅳ期晚期炎症性乳腺癌(IBC)患者纳入回顾性分析,所有患者均为女性,包括15名白种人,2名非洲裔美国人,一个西班牙裔,一个亚裔。诊断时的中位年龄为47.6岁(32-69岁)。从他们的肿瘤中采集血样进行分析。2

在这些患者中最常检测到的致病性变体或可能的致病性变体包括tp53in 47.3%、PMS2in 26.3%、MRE11in 26.3%、BRCA1in 10.5%、RB1in 10.5%、ARin 10.5%和ptein 10.5%。在该人群中检测到的41个变异中,21个(51.2%)同时存在于恶性组织/细胞和成对cfDNA中。此外,在组织中检测到13个(31.7%),仅在cfDNA中检测到7个(17.1%),在组织中也检测到

致病性变体(n=4),但研究人员注意到这些变体是高等位基因片段(AF)>10%。这些包括men1、PIK3CA、ESR1和ncor1。在两个组织中均检测到

致病性变体,并在AF~50%的液体活检中检测到匹配的cfDNA,包括brca1、BRCA2和TP53;这些都是假定的生殖系变体。虽然白细胞、成纤维细胞和正常组织样本不可用于本研究,但2名患者的BRCAvariants经诊断时进行的临床试验证实为同源性。

15名患者同时采集了组织和血液样本,这使得他们的样本能够被分析,以确定组织和配对的血液cfDNA之间的一致性。研究者在分析cfDNA图谱后确定了3组变异:一组低AF变异,一组以50%AF为中心的中间变异,一组以100%AF为中心的高AF变异可能代表纯合生殖系变异。在肿瘤组织和cfDNA中均检测到变异,而其他变异仅在组织中或cfDNA中检测到。

研究人员根据分析一致性部分包含变异的标准,在15名患者中共发现221个变异。其中195个在恶性组织/细胞中检测到,其中155个在cfDNA中检测到,敏感性为79.5%。在检测到的181个cfDNA变异中,155个在组织中检测到,阳性预测值为85.6%

,AF≥10%的变异中,93.7%在cfDNA和恶性组织/细胞中检测到,而在恶性组织/细胞和cfDNA中分别检测到73.3%的5%≤AF<10%的变异。然而,只有36.8%的组织AF<5%的变异在cfDNA中被检测到。

研究人员得出结论,通过液体活检获得的遗传图谱